APEX 蛋白标记（ascorbate peroxidase-based proximity labeling）是一种基于抗坏血酸过氧化物酶的邻近标记技术。APEX 是一种来源于植物的过氧化物酶，能够催化生物素酰胺-酚（biotin-phenol, BP）或其他酚类底物在过氧化氢（H₂O₂）存在下形成活性自由基。这些自由基的半衰期极短，仅能扩散约 20 nm，从而能够在短时间（秒级）内选择性地标记 APEX 附近的蛋白质，而不会影响远离 APEX 的蛋白。随后，通过链霉亲和素亲和纯化和质谱分析可以高效鉴定邻近的蛋白质组。APEX 蛋白标记的主要作用在于揭示细胞内蛋白的空间分布及动态相互作用。该方法能够在活细胞内实现快速标记，不受细胞固定、通透性等限制，特别适用于研究特定亚细胞结构或短时相互作用的蛋白质网络。例如，在神经生物学研究中，APEX 蛋白标记被用于解析突触相关蛋白的组成，以研究神经递质传递过程中的关键调控蛋白。此外，在线粒体、内质网、高尔基体等亚细胞器蛋白组学研究中，APEX 也展现出独特的优势，能够在细胞生理环境下精确标记并富集特定细胞器的蛋白组。近年来，该技术在病毒学、癌症生物学以及免疫信号通路研究中也得到了广泛应用，为解析复杂的蛋白相互作用网络提供了强有力的工具。

APEX 蛋白标记的优势之一在于其标记速度快、空间分辨率高，可在 1 分钟内完成邻近蛋白的生物素化，极大地降低了细胞状态变化对实验结果的干扰。同时，由于生物素-链霉亲和素系统的高亲和力，APEX 标记的蛋白可以高效富集，提高质谱鉴定的灵敏度。此外，APEX 可基因编码并融合到靶蛋白上，使其能够靶向特定细胞器或蛋白复合物，为解析动态蛋白质网络提供工具。

与其他邻近标记技术（如 BioID）相比，APEX 蛋白标记的时间分辨率更高，适用于快速发生的蛋白相互作用事件，而 BioID 需要较长的孵育时间（通常为 18–24 小时）。此外，APEX 可在无氧环境下发挥作用，使其成为研究线粒体、核孔复合物等缺氧环境中的蛋白互作网络的理想选择。然而，APEX 也存在一定局限性，例如可能引入非特异性背景噪音，且 H₂O₂ 处理可能对细胞产生氧化损伤，因此实验设计时需优化 H₂O₂ 浓度和处理时间，以确保实验的特异性和可靠性。

近年来，APEX 蛋白标记技术的改进不断推进其应用边界。例如，APEX2 作为 APEX 的改良版本，具有更高的催化活性和稳定性，可在更低浓度的 H₂O₂ 下实现高效标记，减少细胞毒性。此外，结合 CRISPR-Cas9 介导的基因编辑技术，APEX 使得细胞器蛋白组学研究更加精准，可在内源水平上实现靶蛋白的特异性标记，提高数据的生理相关性。

百泰派克生物科技依托先进的蛋白质组学平台，为客户提供高质量的蛋白分析服务。我们具备丰富的实验优化经验，能够根据不同研究需求优化标记条件，提高实验的灵敏度和特异性。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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